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Text File  |  1996-02-27  |  3KB  |  52 lines
  1.        Document 0107
  2.  DOCN  M9630107
  3.  TI    Quantitative analysis of serum neutralization of human immunodeficiency
  4.        virus type 1 from subtypes A, B, C, D, E, F, and I: lack of direct
  5.        correlation between neutralization serotypes and genetic subtypes and
  6.        evidence for prevalent serum-dependent infectivity enhancement.
  7.  DT    9603
  8.  AU    Kostrikis LG; Cao Y; Ngai H; Moore JP; Ho DD; Aaron Diamond AIDS
  9.        Research Center, New York University School of; Medicine, New York
  10.        10016, USA.
  11.  SO    J Virol. 1996 Jan;70(1):445-58. Unique Identifier : AIDSLINE
  12.        MED/96099459
  13.  AB    Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) M group strains have been
  14.        assigned to date to nine distinct genetic subtypes, designated A through
  15.        I, according to phylogenetic analyses of nucleotide sequences of their
  16.        env or gag genes. Whether there is any relationship between phylogenetic
  17.        subtypes and the neutralization serotypes is not clear, yet defining the
  18.        nature of any such relationship by mathematical means would be of major
  19.        importance for the development of globally effective HIV-1 vaccines. We
  20.        have therefore developed a quantitative method to analyze serum
  21.        neutralization of HIV-1 isolates and to identify HIV-1 neutralization
  22.        serotypes. This method involves calculations of the neutralization
  23.        index, N(i), a newly defined parameter derived from plots generated from
  24.        in vitro neutralization assays, calculations of pairwise serum-virus
  25.        vector distances, and cluster analyses. We have applied this approach to
  26.        analyze three independent neutralization matrices involving primary
  27.        HIV-1 strains and sera from genetic subtypes A, B, C, D, E, F, and I.
  28.        Detailed serum and HIV-1 isolate cluster analyses have shown that in
  29.        general, the identified neutralization serotypes do not directly
  30.        correlate with HIV-1 genetic subtypes. These results suggest that
  31.        neutralization serotypes do not during natural HIV-1 infection are not
  32.        governed by antibodies directed against simple epitopes within gp120
  33.        monomers. A significant proportion (28%) of 1,213 combinations of sera
  34.        and HIV-1 isolates caused serum-dependent infectivity enhancement
  35.        [negative N(i) values] rather than neutralization. We also noted that
  36.        negative N(i) values tended to correlate better with certain HIV-1
  37.        isolates rather than with HIV-1-positive sera. Syncytium-inducing
  38.        variants of HIV-1 were slightly more likely than non-syncytium-inducing
  39.        variants to undergo serum-dependent infectivity enhancement, although
  40.        the latter variants could clearly be susceptible to enhancement.
  41.  DE    Amino Acids/IMMUNOLOGY  Cluster Analysis  Human  HIV
  42.        Antibodies/IMMUNOLOGY  HIV Envelope Protein gp120/IMMUNOLOGY  HIV
  43.        Infections/BLOOD/*IMMUNOLOGY
  44.        HIV-1/CLASSIFICATION/GENETICS/*IMMUNOLOGY/ISOLATION & PURIF
  45.        Neutralization Tests  Peptide Fragments/IMMUNOLOGY  Phylogeny
  46.        Serotyping  Support, Non-U.S. Gov't  Support, U.S. Gov't, P.H.S.
  47.        JOURNAL ARTICLE
  48.  
  49.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  50.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  51.  
  52.